Mentype® DIPquant

Hoch-sensitives Chimärismusmonitoring

Features

  • Frühzeitige Erkennung eines imminenten Rezidivs
  • Nachweis spezifischer Allelanteile zwischen 0,05 % und 12,5 % Chimärismus
  • Auf Standard-qPCR Systemen anwendbar

Nach einer initialen Genotypisierung ermöglicht Mentype® DIPquant eine sensitive Chimärismusdiagnostik, welche zum Nachweis kleinster Veränderungen im Chimärismusstatus des Patienten geeignet ist. So kann ein Rezidiv früher erkannt werden als unter Verwendung weniger empfindliche Methoden. Mentype® DIPquant ist das Tool für die hochsensitive Chimärismusanalyse, wenn der DNA-Einsatz nicht limitierend ist. Sollte die verfügbare DNA-Menge begrenzt sein, so ist die semi-quantitative Chimärismusdiagnostik mit Mentype® DIPscreen über breitere Chimärismusbereiche möglich. Die Kombination aus Mentype® DIPscreen und Mentype® DIPquant deckt damit alle Bereiche der Diagnostik für die Routineanalyse ab.

Biomarker

Insertions-Deletions Polymorphismen (DIPs oder INDELs), Referenzgen

Produktspezifikationen

  • Panel
  • 56 allelspezifische Singleplex-Assays,  1 Referenzassay
  • Reaktionen
  • 3 allelspezifische Assays + Referenzassay in Duplikaten (8 Reaktionen pro Probe)
  • PCR-Kontrollen
  • 2 (PC durch bestehende Proben, NTC)
  • Probeneinsatz
  • 250 ng gDNA aus periphärem Vollblut
  • Sensitivität
  • ≥ 0,05 %
  • Bearbeitungszeit
  • ~ 1,5 h nach Nukleinsäurevorbereitung
  • Nachweis
  • Relative Quantifizierung
  • Zu verwenden mit
  • Standard qPCR-Cycler (FAM)
  • Datenanalyse
  • ChimerisMonitor (RUO), Cycler-spezifische Software, ∆∆Ct Berechnung

Wissenschaftlicher Hintergrund

Die Analyse des molekularen Chimärismus nach allogener Knochenmark- und Blutstammzelltransplantation ist entscheidend, um das Anwachsen des Transplantates zu überwachen bzw. um eine drohende Abstoßungsreaktion frühzeitig zu erkennen. Die molekulare Chimärismusanalyse erfolgt über den Nachweis individualspezifischer Deletions / Insertions DNA-Polymorphismen, welche im Vergleich zu anderen DNA-Sequenzmotiven sehr gut für die Analyse mittels allel-spezifischer qPCR geeignet sind.

Im Anschluss an die Identifizierung informativer DIP-Loci des Patienten und des Spenders mit dem CE-IVD Mentype® DIPscreen Kit kann mit den entsprechenden Mentype® DIPquant Singleplex-Assays die quantitative Chimärismusanalyse erfolgen. Das flexible Assayformat erlaubt sowohl die Analyse einzelner Proben als auch großer Probenmengen mit minimalem Materialaufwand. Da die hohe Sensitivität der qPCR methodenbedingt mit einer begrenzten Genauigkeit im Bereich des gemischten Chimärismus verbunden ist, wird empfohlen, Proben mit gemischtem Chimärismus mittels des Mentype® DIPscreen Kits zu analysieren (Leitlinie zur allogenen Stammzelltransplantation der Deutschen Arbeitsgemeinschaft für Knochenmark- und Blutstammzelltransplantation (DAG-KBT); Bader et al. 2016).

Produktreferenzen

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  2. Al-Akioui Sanz, K. et al. Familial CD45RA– T cells to treat severe refractory infections in immunocompromised patients. Front. Med. 10. https://doi.org/10.3389/fmed.2023.1083215 (2023)
  3. Huyveneers, L. E. P. et al. Autopsy Study Defines Composition and Dynamics of the HIV-1 Reservoir after Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation with CCR5D32/D32 Donor Cells. Viruses 14. https://doi.org/10.3390/v14092069 (2022)
  4. Pérez-Martínes, A. et al. Phase I dose-escalation single centre clinical trial to evaluate the safety of infusion of memory T cells as adoptive therapy in COVID-19 (RELEASE). EClinicalMedicine 39. https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2021.101086 (2021)
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  9. Navarro-Bailón, A. et al. A Novel Quantitative PCR Approach Targeting Insertion/Deletion Polymorphisms (Indel-PCR) for Chimerism Quantification: Finally High Sensitivity and Quantification Capacity Together. Blood 126, 4227. https://doi.org/10.1182/blood.V126.23.4277.4277 (2015)
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  11. Willasch, A. M. et al. Monitoring of Hematopoietic Chimerism after Transplantation for Pediatric Myelodysplastic Syndrome: Real-Time or Conventional Short Tandem Repeat PCR in Peripheral Blood or Bone Marrow? Biol Blood Marrow Transplant 20, 1918-1925. https://doi.org/10.1016/j.bbmt.2014.07.030 (2014)

Bestellinformationen

Mentype® DIPquant (allelspezifische Assays, Referenzgen)

Größe: 25 Reaktionen
Artikelnummer: 45-015xx*-0025
Status: CE-IVD

* xx beschreibt die locusspezifische Artikelnummer


Mentype® DIPquant Reference (Referenzgen)

Größe: 100 Reaktionen
Artikelnummer: 45-01591-0100
Status: CE-IVD

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