Mentype® DIPquant

Hochsensitives Chimärismusmonitoring

Features

Hochempfindliche Methode zur Quantifizierung des Chimärismus
Nachweis spezifischer Allelanteile zwischen 0,05 % und 12,5 % Chimärismus
Auf Standard-qPCR-Systemen anwendbar

Nach der Genotypisierung mit Mentype^® DIPscreen kann der qPCR-basierte Assay Mentype^® DIPquant zur relativen Quantifizierung des Chimärismus eingesetzt werden. Dank seines schnellen, einfachen Arbeitsablaufs und seiner hohen Empfindlichkeit eignet sich Mentype^® DIPquant ideal für die routinemäßige Chimärismus-Analyse, wenn die DNA-Menge kein limitierender Faktor ist. Daher ist es ideal für alle Forschungsanwendungen, die eine hochempfindliche Chimärismus-Analyse erfordern. Bei begrenzter DNA-Menge wird eine semiquantitative Analyse mit Mentype^® DIPscreen empfohlen.

Biomarker

Insertions-Deletions Polymorphismen (DIPs oder INDELs), Referenzgen

Produktspezifikationen

Panel
56 allelspezifische Singleplex-Assays 1 Referenzassay

Reaktionen
3 allelspezifische Assays + Referenzassay in Duplikaten (8 Reaktionen pro Probe)

PCR-Kontrollen
2 (PC durch bestehende Proben oder DIP Positive Control, NTC)

Probeneinsatz
250 ng gDNA aus periphärem Vollblut

Sensitivität
≥ 0,05 %

Bearbeitungszeit
~ 1,5 h nach Nukleinsäurevorbereitung

Nachweis
Relative Quantifizierung

Zu verwenden mit
Standard qPCR-Cycler (FAM)

Datenanalyse
ChimerisMonitor (RUO), Cycler-spezifische Software, ∆∆Ct Berechnung

Workflow

Wissenschaftlicher Hintergrund

Der Begriff „Chimärismus“ bezeichnet einen Organismus, der mehrere genetisch unterschiedliche Zelllinien in einem Körper vereint. Der menschliche Chimärismus bezieht sich auf das Vorhandensein genetisch unterschiedlicher Zellpopulationen innerhalb eines einzelnen Individuums. Dieser Zustand kann auf natürliche Weise entstehen – beispielsweise durch tetragametische Fusion, Zellaustausch zwischen Zwillingen oder mütterlichen fötalen Mikrochimärismus – oder künstlich durch medizinische Verfahren wie Knochenmark- oder Organtransplantationen. Chimärismus ist im Grunde genommen ein biologischer Zustand, der nicht von Natur aus pathologisch ist und eine wichtige Rolle für das Verständnis der menschlichen Entwicklungsbiologie spielt. In der Evolutions- und Entwicklungsforschung bietet Chimärismus Einblicke in die Rückverfolgung von Zelllinien, die Entwicklungsplastizität und die Immuntoleranz. Beispielsweise zeigt Mikrochimärismus, wie fremde Zellen über Jahrzehnte hinweg bestehen bleiben können, und bietet damit ein natürliches Modell für die langfristige Zelltransplantation und den Zelltransfer zwischen Individuen.

Die molekulare Chimärismus-Analyse erfolgt durch den Nachweis von Deletions-/Insertionspolymorphismen, die im Vergleich zu anderen DNA-Sequenzmotiven für die Analyse mittels allelspezifischer qPCR-Technologie hervorragend geeignet sind.

Produktreferenzen

Hernández-Blanco et al. The phase I RELEASE clinical trial to evaluate the safety of NK cells in COVID-19. iScience 28, 111698, https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.111698 (2025)
Ferreras, C. et al. Results of phase 2 randomized multi-center study to evaluate the safety and efficacy of infusion of memory T cells as adoptive therapy in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pneumonia and/or lymphopenia (RELEASE NCT04578210). Cytotherapy 26, 25-35, https://doi.org/10.1016/j.jcyt.2023.10.002 (2024)
Al-Akioui Sanz, K. et al. Familial CD45RA– T cells to treat severe refractory infections in immunocompromised patients. Front. Med. 10. https://doi.org/10.3389/fmed.2023.1083215 (2023)
Huyveneers, L. E. P. et al. Autopsy Study Defines Composition and Dynamics of the HIV-1 Reservoir after Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation with CCR5D32/D32 Donor Cells. Viruses 14. https://doi.org/10.3390/v14092069 (2022)
Pérez-Martínes, A. et al. Phase I dose-escalation single centre clinical trial to evaluate the safety of infusion of memory T cells as adoptive therapy in COVID-19 (RELEASE). EClinicalMedicine 39. https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2021.101086 (2021)
Gómez-García, L. M. et al. A phase II clinical trial of infusing haploidentical K562-mb-IL15-41BBL activated and expanded Natural Killer cells as consolidation therapy for pediatric acute myeloblastic leukemia. ESS Open Archive. DOI: 10.22541/au.160192968.85891275/v1 (2020)
Navarro-Bailón, A et al. Short Tandem Repeats (STRs) as Biomarkers for the Quantitative Follow-Up of Chimerism after Stem Cell Transplantation: Methodological Considerations and Clinical Application. Genes 11, 993. https://doi.org/10.3390/genes11090993 (2020)
Salgado, M. et al. Mechanisms That Contribute to a Profound Reduction of the HIV-1 Reservoir After Allogeneic Stem Cell Transplant. Annals of Internal Medicine 169, 674-683. https://doi.org/10.7326/M18-0759 (2018)
Sellmann, L. et al. Diagnostic value of highly-sensitive chimerism analysis after allogeneic stem cell transplantation. Bone Marrow Transplant 53, 1457-1465. https://doi.org/10.1038/s41409-018-0176-7 (2018)
Navarro-Bailón, A. et al. A Novel Quantitative PCR Approach Targeting Insertion/Deletion Polymorphisms (Indel-PCR) for Chimerism Quantification: Finally High Sensitivity and Quantification Capacity Together. Blood 126, 4227. https://doi.org/10.1182/blood.V126.23.4277.4277 (2015)
Stahl, T. et al. Digital PCR to assess hematopoietic chimerism after allogeneic stem cell transplantation. Experimental Hematology 43, 462-468. https://doi.org/10.1016/j.exphem.2015.02.006 (2015)
Willasch, A. M. et al. Monitoring of Hematopoietic Chimerism after Transplantation for Pediatric Myelodysplastic Syndrome: Real-Time or Conventional Short Tandem Repeat PCR in Peripheral Blood or Bone Marrow? Biol Blood Marrow Transplant 20, 1918-1925. https://doi.org/10.1016/j.bbmt.2014.07.030 (2014)